Основные направления работ, выполняемых отделом мониторинга лесных генетических ресурсов:

- мониторинг состояния лесных генетических ресурсов;

- контроль над оборотом репродуктивного материала лесных растений при воспроизводстве лесов;

- оценка фитосанитарного состояния лесных питомников;

- контроль законности происхождения древесины.

В рамках реализации вышеуказанной деятельности осуществляются:

- определение ботанического рода и вида древесной породы по строению древесины предоставляемых образцов (идентификация породы);

- разработка и внедрение методов генной диагностики (ДНК-диагностики) в практику лесопатологического мониторинга;

- установление внутривидовой дифференциации основных лесообразующих пород (определение границ подвидов, экотипов, популяций в пределах их ареалов);

-определение географического происхождения репродуктивного материала, раннее выявление очагов болезней леса;

- установление степени поражения сеянцев и саженцев лесных растений патогенной микрофлорой в лесных питомниках;

- генетическая паспортизация объектов лесного семеноводства (плюсовых деревьев, плюсовых насаждений и др.).